Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK9P50750 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK9P50750 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK9P50750 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK9P50750 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK9P50750 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK9P50750 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK9P50750 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK9P50750 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK9P50750 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK9P50750 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK9P50750 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK9P50750 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK9P50750 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK9P50750 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK9P50750 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK9P50750 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK9P50750 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK9P50750 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK9P50750 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK9P50750 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK9P50750 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK9P50750 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK9P50750 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK9P50750 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK9P50750 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK9P50750 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK9P50750 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK9P50750 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK9P50750 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK9P50750 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK9P50750 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK9P50750 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK9P50750 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK9P50750 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK9P50750 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK9P50750 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK9P50750 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK9P50750 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK9P50750 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK9P50750 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK9P50750 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK9P50750 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK9P50750 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK9P50750 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK9P50750 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK9P50750 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK9P50750 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK9P50750 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK9P50750 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK9P50750 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK9P50750 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK9P50750 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK9P50750 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK9P50750 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK9P50750 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK9P50750 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK9P50750 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK9P50750 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK9P50750 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK9P50750 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK9P50750 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK9P50750 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK9P50750 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK9P50750 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK9P50750 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK9P50750 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK9P50750 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK9P50750 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK9P50750 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK9P50750 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK9P50750 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK9P50750 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK9P50750 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK9P50750 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK9P50750 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK9P50750 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK9P50750 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK9P50750 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK9P50750 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK9P50750 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK9P50750 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK9P50750 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK9P50750 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms