Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK7P50613 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK7P50613 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK7P50613 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK7P50613 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK7P50613 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK7P50613 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK7P50613 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK7P50613 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK7P50613 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK7P50613 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK7P50613 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK7P50613 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK7P50613 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK7P50613 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK7P50613 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK7P50613 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK7P50613 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK7P50613 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK7P50613 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK7P50613 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK7P50613 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK7P50613 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK7P50613 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK7P50613 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK7P50613 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK7P50613 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK7P50613 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK7P50613 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK7P50613 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK7P50613 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK7P50613 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK7P50613 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK7P50613 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK7P50613 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK7P50613 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK7P50613 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK7P50613 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK7P50613 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK7P50613 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK7P50613 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK7P50613 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK7P50613 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK7P50613 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK7P50613 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK7P50613 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK7P50613 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK7P50613 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK7P50613 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK7P50613 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK7P50613 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK7P50613 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK7P50613 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK7P50613 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK7P50613 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK7P50613 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK7P50613 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK7P50613 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK7P50613 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK7P50613 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK7P50613 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK7P50613 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK7P50613 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK7P50613 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK7P50613 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK7P50613 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK7P50613 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK7P50613 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK7P50613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK7P50613 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK7P50613 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK7P50613 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK7P50613 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK7P50613 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK7P50613 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK7P50613 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK7P50613 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK7P50613 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK7P50613 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms