Protein–RNA interactions for Protein: P50452

SERPINB8, Serpin B8, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB8P50452 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINB8P50452 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINB8P50452 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINB8P50452 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms