Protein–RNA interactions for Protein: P50416

CPT1A, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1AP50416 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPT1AP50416 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPT1AP50416 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPT1AP50416 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPT1AP50416 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPT1AP50416 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPT1AP50416 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPT1AP50416 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPT1AP50416 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPT1AP50416 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CPT1AP50416 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CPT1AP50416 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPT1AP50416 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPT1AP50416 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CPT1AP50416 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CPT1AP50416 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CPT1AP50416 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPT1AP50416 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CPT1AP50416 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPT1AP50416 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CPT1AP50416 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CPT1AP50416 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPT1AP50416 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPT1AP50416 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPT1AP50416 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms