Protein–RNA interactions for Protein: P50221

MEOX1, Homeobox protein MOX-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEOX1P50221 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEOX1P50221 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEOX1P50221 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEOX1P50221 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEOX1P50221 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEOX1P50221 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEOX1P50221 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEOX1P50221 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEOX1P50221 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEOX1P50221 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms