Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3BP49841 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms