Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A2P49281 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A2P49281 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A2P49281 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms