Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD97P48960 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD97P48960 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD97P48960 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD97P48960 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD97P48960 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD97P48960 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD97P48960 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD97P48960 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD97P48960 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CD97P48960 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD97P48960 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD97P48960 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD97P48960 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD97P48960 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD97P48960 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD97P48960 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD97P48960 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD97P48960 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD97P48960 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD97P48960 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD97P48960 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD97P48960 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD97P48960 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD97P48960 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD97P48960 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD97P48960 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD97P48960 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD97P48960 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD97P48960 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD97P48960 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD97P48960 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD97P48960 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD97P48960 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD97P48960 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD97P48960 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD97P48960 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD97P48960 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD97P48960 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD97P48960 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD97P48960 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD97P48960 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD97P48960 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD97P48960 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD97P48960 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD97P48960 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD97P48960 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD97P48960 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD97P48960 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD97P48960 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD97P48960 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD97P48960 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD97P48960 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD97P48960 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD97P48960 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD97P48960 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD97P48960 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD97P48960 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD97P48960 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD97P48960 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD97P48960 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD97P48960 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD97P48960 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD97P48960 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms