Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSFP46459 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSFP46459 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSFP46459 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSFP46459 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSFP46459 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSFP46459 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSFP46459 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSFP46459 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSFP46459 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSFP46459 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSFP46459 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSFP46459 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSFP46459 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSFP46459 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSFP46459 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSFP46459 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSFP46459 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSFP46459 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSFP46459 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NSFP46459 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSFP46459 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSFP46459 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSFP46459 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSFP46459 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSFP46459 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSFP46459 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NSFP46459 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSFP46459 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSFP46459 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSFP46459 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSFP46459 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSFP46459 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSFP46459 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSFP46459 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSFP46459 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSFP46459 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSFP46459 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSFP46459 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSFP46459 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSFP46459 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSFP46459 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSFP46459 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSFP46459 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSFP46459 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSFP46459 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSFP46459 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSFP46459 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSFP46459 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSFP46459 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSFP46459 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NSFP46459 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSFP46459 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSFP46459 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSFP46459 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSFP46459 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSFP46459 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSFP46459 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSFP46459 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSFP46459 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSFP46459 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSFP46459 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSFP46459 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSFP46459 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSFP46459 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSFP46459 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSFP46459 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSFP46459 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSFP46459 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSFP46459 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSFP46459 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSFP46459 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSFP46459 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSFP46459 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms