Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSBP45954 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSBP45954 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms