Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT3P45378 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT3P45378 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms