Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA4P43681 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA4P43681 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms