Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFMP43652 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
AFMP43652 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFMP43652 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.54■■■□□ 2
AFMP43652 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFMP43652 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AFMP43652 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFMP43652 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFMP43652 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFMP43652 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFMP43652 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFMP43652 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFMP43652 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AFMP43652 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFMP43652 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFMP43652 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AFMP43652 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFMP43652 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFMP43652 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFMP43652 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFMP43652 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFMP43652 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFMP43652 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFMP43652 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFMP43652 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFMP43652 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFMP43652 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFMP43652 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFMP43652 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFMP43652 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFMP43652 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFMP43652 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFMP43652 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFMP43652 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFMP43652 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFMP43652 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFMP43652 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AFMP43652 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFMP43652 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFMP43652 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFMP43652 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFMP43652 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFMP43652 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFMP43652 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFMP43652 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFMP43652 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFMP43652 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFMP43652 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFMP43652 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFMP43652 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFMP43652 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFMP43652 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFMP43652 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFMP43652 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFMP43652 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFMP43652 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFMP43652 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFMP43652 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFMP43652 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFMP43652 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFMP43652 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFMP43652 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
AFMP43652 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms