Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 SELENOF-205ENST00000469566 831 ntTSL 210.46□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 LINC00630-203ENST00000431616 561 ntTSL 59.99□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 LINC00630-204ENST00000435966 568 ntTSL 39.88□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 LINC00630-202ENST00000420471 838 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 RABGAP1L-219ENST00000526253 439 ntTSL 59.42□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 SELENOF-204ENST00000467557 499 ntTSL 58.37□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 47.58□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 SELENOF-206ENST00000497861 266 ntTSL 32.87□□□□□ -1.952e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 UBR4-211ENST00000467272 891 ntTSL 513.14□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -17e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 30.8
MATR3P43243 AC084337.2-201ENST00000639224 589 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.9□□□□□ -0.54e-9■■■■■ 30.8
MATR3P43243 BRD7-206ENST00000567826 740 ntTSL 530.95■■■□□ 2.555e-9■■■■■ 30.7
MATR3P43243 BRD7-203ENST00000401491 1338 ntTSL 530.52■■■□□ 2.485e-9■■■■■ 30.7
MATR3P43243 KANTR-201ENST00000366185 1063 ntTSL 324.08■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 30.7
MATR3P43243 PLCG1-211ENST00000490253 527 ntTSL 219.85■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-204ENST00000416605 4729 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 KANTR-204ENST00000604849 1196 ntTSL 518.02■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-217ENST00000551607 324 ntTSL 517.73■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-205ENST00000518629 1915 ntTSL 217.37■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 SMARCAD1-207ENST00000510105 2409 ntTSL 517.28■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-210ENST00000548237 630 ntTSL 415.4■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-212ENST00000548501 598 ntTSL 313.94□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 KANTR-202ENST00000603385 4343 ntTSL 413.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-202ENST00000430608 1303 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-207ENST00000546792 686 ntTSL 312.52□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-209ENST00000547471 573 ntTSL 412.35□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-204ENST00000517734 2860 ntTSL 212.21□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-205ENST00000517424 1866 ntTSL 212.15□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 PLCG1-210ENST00000483646 591 ntTSL 311.45□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-213ENST00000549622 573 ntTSL 411.11□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-208ENST00000547332 593 ntTSL 410.47□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 ST7-OT4-202ENST00000397751 754 ntTSL 310.42□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-203ENST00000451750 1011 ntTSL 29.65□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 CYP4F12-211ENST00000548435 567 ntTSL 49.53□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-209ENST00000518503 1608 ntTSL 58.92□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 TAF1B-205ENST00000434858 1592 ntTSL 28.8□□□□□ -11e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-206ENST00000517995 2809 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-208ENST00000518402 1521 ntTSL 56.71□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 SMARCAD1-203ENST00000394961 3778 ntTSL 26.65□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 HACE1-203ENST00000369127 5318 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 ST7-OT4-204ENST00000470996 416 ntTSL 23.53□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.951e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.061e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 SMARCAD1-202ENST00000359052 5017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best)1.52□□□□□ -2.171e-7■■■■■ 30.7
MATR3P43243 FARP1-237ENST00000601853 749 ntTSL 516.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 FARP1-215ENST00000595817 778 ntTSL 512□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 FARP1-213ENST00000595380 616 ntTSL 511.8□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 FARP1-240ENST00000602263 867 ntTSL 511.44□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 FARP1-226ENST00000599040 555 ntTSL 510.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 FARP1-228ENST00000600032 810 ntTSL 510.05□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 FARP1-220ENST00000596613 856 ntTSL 59.06□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 FARP1-217ENST00000596467 799 ntTSL 58.86□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 TBCA-208ENST00000520361 446 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 TBCA-201ENST00000306388 2301 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 30.6
MATR3P43243 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 30.6
MATR3P43243 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)26.03■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 30.6
MATR3P43243 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 324.86■■□□□ 1.574e-7■■■■■ 30.6
MATR3P43243 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.474e-7■■■■■ 30.6
MATR3P43243 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 30.5
MATR3P43243 PLEKHA6-204ENST00000564627 275 ntTSL 314.64□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.651e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-206ENST00000457077 574 ntTSL 419.74■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 30.5
MATR3P43243 MNAT1-208ENST00000556764 1097 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 30.4
MATR3P43243 MNAT1-206ENST00000555545 612 ntTSL 314.44□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 30.4
MATR3P43243 MNAT1-203ENST00000553354 277 ntTSL 212.83□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 30.4
MATR3P43243 ACSL4-212ENST00000514500 696 ntTSL 515.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 30.4
MATR3P43243 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 30.4
MATR3P43243 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 30.4
MATR3P43243 KIAA1324L-204ENST00000423294 2911 ntTSL 516.99■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 30.4
MATR3P43243 LINC01748-201ENST00000439156 1798 ntTSL 513.75□□□□□ -0.211e-11■■■■■ 30.3
MATR3P43243 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 30.3
MATR3P43243 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 30.3
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