Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSG1P42857 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSG1P42857 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSG1P42857 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSG1P42857 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSG1P42857 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSG1P42857 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSG1P42857 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSG1P42857 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSG1P42857 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSG1P42857 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSG1P42857 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSG1P42857 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSG1P42857 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSG1P42857 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSG1P42857 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSG1P42857 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSG1P42857 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSG1P42857 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSG1P42857 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSG1P42857 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSG1P42857 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSG1P42857 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSG1P42857 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSG1P42857 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSG1P42857 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSG1P42857 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSG1P42857 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSG1P42857 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSG1P42857 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSG1P42857 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSG1P42857 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSG1P42857 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSG1P42857 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSG1P42857 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSG1P42857 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSG1P42857 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSG1P42857 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSG1P42857 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSG1P42857 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSG1P42857 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSG1P42857 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSG1P42857 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSG1P42857 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSG1P42857 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSG1P42857 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSG1P42857 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSG1P42857 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSG1P42857 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSG1P42857 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSG1P42857 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSG1P42857 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSG1P42857 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSG1P42857 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSG1P42857 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSG1P42857 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSG1P42857 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSG1P42857 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSG1P42857 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSG1P42857 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSG1P42857 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSG1P42857 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSG1P42857 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSG1P42857 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSG1P42857 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSG1P42857 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSG1P42857 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms