Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PI4KAP42356 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PI4KAP42356 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms