Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC5P40937 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC5P40937 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC5P40937 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC5P40937 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC5P40937 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC5P40937 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC5P40937 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC5P40937 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC5P40937 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC5P40937 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC5P40937 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC5P40937 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC5P40937 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC5P40937 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC5P40937 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC5P40937 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC5P40937 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC5P40937 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC5P40937 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC5P40937 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC5P40937 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC5P40937 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC5P40937 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC5P40937 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC5P40937 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC5P40937 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC5P40937 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC5P40937 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC5P40937 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC5P40937 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC5P40937 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC5P40937 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC5P40937 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC5P40937 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC5P40937 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC5P40937 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC5P40937 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC5P40937 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC5P40937 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC5P40937 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC5P40937 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFC5P40937 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC5P40937 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC5P40937 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC5P40937 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC5P40937 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC5P40937 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC5P40937 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC5P40937 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC5P40937 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC5P40937 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC5P40937 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC5P40937 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC5P40937 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC5P40937 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC5P40937 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC5P40937 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC5P40937 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC5P40937 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC5P40937 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC5P40937 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC5P40937 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC5P40937 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC5P40937 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC5P40937 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC5P40937 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC5P40937 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RFC5P40937 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC5P40937 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC5P40937 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC5P40937 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC5P40937 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC5P40937 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC5P40937 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC5P40937 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC5P40937 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC5P40937 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC5P40937 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC5P40937 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC5P40937 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC5P40937 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC5P40937 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC5P40937 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC5P40937 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms