Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HSPA9P38646 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSPA9P38646 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HSPA9P38646 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms