Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ETFBP38117 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ETFBP38117 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ETFBP38117 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETFBP38117 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETFBP38117 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ETFBP38117 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETFBP38117 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETFBP38117 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETFBP38117 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETFBP38117 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETFBP38117 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETFBP38117 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETFBP38117 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETFBP38117 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETFBP38117 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETFBP38117 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ETFBP38117 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETFBP38117 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETFBP38117 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETFBP38117 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETFBP38117 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETFBP38117 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETFBP38117 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETFBP38117 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETFBP38117 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ETFBP38117 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETFBP38117 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ETFBP38117 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETFBP38117 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ETFBP38117 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ETFBP38117 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETFBP38117 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETFBP38117 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETFBP38117 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETFBP38117 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETFBP38117 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETFBP38117 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETFBP38117 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ETFBP38117 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ETFBP38117 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETFBP38117 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETFBP38117 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETFBP38117 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETFBP38117 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETFBP38117 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETFBP38117 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETFBP38117 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETFBP38117 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETFBP38117 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETFBP38117 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETFBP38117 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETFBP38117 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ETFBP38117 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ETFBP38117 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ETFBP38117 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ETFBP38117 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ETFBP38117 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETFBP38117 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETFBP38117 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETFBP38117 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ETFBP38117 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETFBP38117 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETFBP38117 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ETFBP38117 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ETFBP38117 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ETFBP38117 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETFBP38117 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETFBP38117 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETFBP38117 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETFBP38117 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETFBP38117 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETFBP38117 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETFBP38117 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETFBP38117 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETFBP38117 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETFBP38117 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms