Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH11P35749 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH11P35749 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH11P35749 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH11P35749 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH11P35749 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYH11P35749 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYH11P35749 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH11P35749 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH11P35749 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH11P35749 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH11P35749 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH11P35749 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH11P35749 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH11P35749 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH11P35749 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH11P35749 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH11P35749 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH11P35749 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH11P35749 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH11P35749 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH11P35749 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH11P35749 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH11P35749 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH11P35749 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH11P35749 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH11P35749 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH11P35749 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYH11P35749 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MYH11P35749 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH11P35749 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH11P35749 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH11P35749 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH11P35749 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH11P35749 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH11P35749 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH11P35749 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH11P35749 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH11P35749 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH11P35749 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH11P35749 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH11P35749 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH11P35749 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH11P35749 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH11P35749 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH11P35749 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH11P35749 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH11P35749 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH11P35749 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH11P35749 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH11P35749 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH11P35749 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYH11P35749 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYH11P35749 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYH11P35749 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYH11P35749 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYH11P35749 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYH11P35749 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYH11P35749 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYH11P35749 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MYH11P35749 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MYH11P35749 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYH11P35749 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYH11P35749 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYH11P35749 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYH11P35749 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYH11P35749 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYH11P35749 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYH11P35749 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYH11P35749 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYH11P35749 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYH11P35749 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYH11P35749 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYH11P35749 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYH11P35749 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYH11P35749 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYH11P35749 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYH11P35749 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYH11P35749 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYH11P35749 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYH11P35749 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYH11P35749 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYH11P35749 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MYH11P35749 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYH11P35749 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms