Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD13P35453 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXD13P35453 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD13P35453 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD13P35453 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD13P35453 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms