Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CYP2C19P33261 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP2C19P33261 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP2C19P33261 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms