Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTX2P32243 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTX2P32243 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTX2P32243 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX2P32243 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX2P32243 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX2P32243 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX2P32243 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX2P32243 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX2P32243 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX2P32243 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX2P32243 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX2P32243 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX2P32243 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX2P32243 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTX2P32243 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTX2P32243 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTX2P32243 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX2P32243 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX2P32243 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX2P32243 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX2P32243 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX2P32243 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX2P32243 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX2P32243 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX2P32243 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX2P32243 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX2P32243 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX2P32243 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX2P32243 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX2P32243 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX2P32243 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX2P32243 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX2P32243 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX2P32243 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTX2P32243 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTX2P32243 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTX2P32243 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTX2P32243 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTX2P32243 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTX2P32243 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX2P32243 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTX2P32243 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTX2P32243 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTX2P32243 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTX2P32243 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTX2P32243 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTX2P32243 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTX2P32243 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTX2P32243 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTX2P32243 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTX2P32243 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTX2P32243 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTX2P32243 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTX2P32243 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTX2P32243 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTX2P32243 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTX2P32243 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTX2P32243 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTX2P32243 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTX2P32243 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTX2P32243 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTX2P32243 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTX2P32243 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTX2P32243 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTX2P32243 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTX2P32243 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTX2P32243 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTX2P32243 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTX2P32243 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTX2P32243 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTX2P32243 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTX2P32243 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTX2P32243 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTX2P32243 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms