Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CLIP1P30622 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CLIP1P30622 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CLIP1P30622 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CLIP1P30622 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms