Protein–RNA interactions for Protein: P29371

TACR3, Neuromedin-K receptor, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR3P29371 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR3P29371 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR3P29371 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR3P29371 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR3P29371 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR3P29371 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR3P29371 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR3P29371 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR3P29371 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR3P29371 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR3P29371 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR3P29371 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR3P29371 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR3P29371 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR3P29371 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR3P29371 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR3P29371 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TACR3P29371 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR3P29371 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR3P29371 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR3P29371 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR3P29371 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR3P29371 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR3P29371 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR3P29371 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR3P29371 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR3P29371 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR3P29371 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR3P29371 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR3P29371 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TACR3P29371 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TACR3P29371 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TACR3P29371 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TACR3P29371 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR3P29371 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR3P29371 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR3P29371 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR3P29371 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR3P29371 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR3P29371 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR3P29371 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR3P29371 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR3P29371 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR3P29371 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR3P29371 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TACR3P29371 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR3P29371 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR3P29371 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR3P29371 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR3P29371 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR3P29371 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR3P29371 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR3P29371 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR3P29371 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR3P29371 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR3P29371 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR3P29371 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR3P29371 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR3P29371 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR3P29371 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR3P29371 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR3P29371 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR3P29371 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR3P29371 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR3P29371 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR3P29371 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR3P29371 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR3P29371 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR3P29371 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR3P29371 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR3P29371 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR3P29371 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TACR3P29371 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR3P29371 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR3P29371 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR3P29371 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR3P29371 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR3P29371 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR3P29371 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR3P29371 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR3P29371 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR3P29371 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR3P29371 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TACR3P29371 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TACR3P29371 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TACR3P29371 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TACR3P29371 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TACR3P29371 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TACR3P29371 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TACR3P29371 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TACR3P29371 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TACR3P29371 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms