Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMOD1P28289 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD1P28289 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms