Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB4P28070 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMB4P28070 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms