Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA2P26232 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA2P26232 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA2P26232 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms