Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDELR1P24390 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDELR1P24390 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR1P24390 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR1P24390 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR1P24390 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR1P24390 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR1P24390 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms