Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRM1P23921 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRM1P23921 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRM1P23921 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRM1P23921 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRM1P23921 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRM1P23921 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRM1P23921 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRM1P23921 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRM1P23921 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRM1P23921 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RRM1P23921 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRM1P23921 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRM1P23921 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRM1P23921 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRM1P23921 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRM1P23921 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RRM1P23921 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRM1P23921 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRM1P23921 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRM1P23921 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRM1P23921 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRM1P23921 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRM1P23921 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRM1P23921 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRM1P23921 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRM1P23921 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRM1P23921 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRM1P23921 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRM1P23921 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRM1P23921 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRM1P23921 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRM1P23921 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRM1P23921 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRM1P23921 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRM1P23921 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRM1P23921 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRM1P23921 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRM1P23921 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRM1P23921 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRM1P23921 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRM1P23921 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRM1P23921 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRM1P23921 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRM1P23921 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRM1P23921 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRM1P23921 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRM1P23921 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRM1P23921 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRM1P23921 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRM1P23921 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRM1P23921 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRM1P23921 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRM1P23921 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRM1P23921 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRM1P23921 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRM1P23921 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRM1P23921 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRM1P23921 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRM1P23921 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRM1P23921 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRM1P23921 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRM1P23921 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRM1P23921 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRM1P23921 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRM1P23921 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRM1P23921 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRM1P23921 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRM1P23921 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRM1P23921 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRM1P23921 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRM1P23921 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRM1P23921 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRM1P23921 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRM1P23921 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRM1P23921 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRM1P23921 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRM1P23921 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms