Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
JAK1P23458 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JAK1P23458 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
JAK1P23458 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
JAK1P23458 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JAK1P23458 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
JAK1P23458 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JAK1P23458 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JAK1P23458 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAK1P23458 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAK1P23458 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAK1P23458 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAK1P23458 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAK1P23458 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
JAK1P23458 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
JAK1P23458 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAK1P23458 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
JAK1P23458 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JAK1P23458 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JAK1P23458 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms