Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPD1P23109 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPD1P23109 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPD1P23109 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPD1P23109 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms