Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTNP21246 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTNP21246 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTNP21246 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTNP21246 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTNP21246 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTNP21246 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PTNP21246 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTNP21246 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTNP21246 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTNP21246 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTNP21246 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTNP21246 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTNP21246 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTNP21246 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTNP21246 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTNP21246 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTNP21246 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTNP21246 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTNP21246 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTNP21246 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTNP21246 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTNP21246 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTNP21246 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTNP21246 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTNP21246 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTNP21246 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTNP21246 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTNP21246 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTNP21246 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTNP21246 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTNP21246 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTNP21246 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTNP21246 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTNP21246 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTNP21246 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTNP21246 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTNP21246 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTNP21246 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTNP21246 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTNP21246 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTNP21246 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTNP21246 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTNP21246 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTNP21246 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTNP21246 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTNP21246 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTNP21246 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTNP21246 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTNP21246 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTNP21246 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTNP21246 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTNP21246 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTNP21246 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTNP21246 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTNP21246 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTNP21246 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTNP21246 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTNP21246 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTNP21246 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTNP21246 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTNP21246 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTNP21246 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTNP21246 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTNP21246 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTNP21246 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTNP21246 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTNP21246 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTNP21246 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTNP21246 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTNP21246 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTNP21246 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTNP21246 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTNP21246 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTNP21246 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTNP21246 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTNP21246 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms