Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD247P20963 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD247P20963 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD247P20963 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD247P20963 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD247P20963 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD247P20963 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD247P20963 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD247P20963 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD247P20963 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD247P20963 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD247P20963 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD247P20963 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD247P20963 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD247P20963 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD247P20963 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD247P20963 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD247P20963 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD247P20963 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD247P20963 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD247P20963 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD247P20963 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD247P20963 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD247P20963 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD247P20963 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD247P20963 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD247P20963 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD247P20963 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD247P20963 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD247P20963 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD247P20963 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD247P20963 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD247P20963 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD247P20963 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD247P20963 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD247P20963 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD247P20963 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD247P20963 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD247P20963 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD247P20963 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD247P20963 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD247P20963 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD247P20963 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD247P20963 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD247P20963 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD247P20963 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD247P20963 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD247P20963 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD247P20963 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD247P20963 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD247P20963 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD247P20963 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD247P20963 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD247P20963 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD247P20963 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD247P20963 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD247P20963 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD247P20963 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD247P20963 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms