Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB3AP20336 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3AP20336 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms