Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF30P17039 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF30P17039 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF30P17039 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF30P17039 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms