Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE6AP16499 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE6AP16499 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE6AP16499 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE6AP16499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE6AP16499 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE6AP16499 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE6AP16499 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE6AP16499 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE6AP16499 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE6AP16499 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE6AP16499 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE6AP16499 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE6AP16499 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE6AP16499 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms