Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GSPT1P15170 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GSPT1P15170 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GSPT1P15170 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms