Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB1P14653 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXB1P14653 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms