Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN1P12814 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN1P12814 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN1P12814 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN1P12814 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN1P12814 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN1P12814 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN1P12814 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN1P12814 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN1P12814 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN1P12814 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN1P12814 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN1P12814 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN1P12814 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN1P12814 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ACTN1P12814 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN1P12814 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN1P12814 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ACTN1P12814 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ACTN1P12814 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACTN1P12814 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTN1P12814 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms