Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP2P12643 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP2P12643 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP2P12643 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP2P12643 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP2P12643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP2P12643 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP2P12643 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP2P12643 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP2P12643 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP2P12643 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP2P12643 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP2P12643 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP2P12643 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP2P12643 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP2P12643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP2P12643 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP2P12643 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP2P12643 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP2P12643 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP2P12643 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP2P12643 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP2P12643 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP2P12643 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP2P12643 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP2P12643 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP2P12643 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP2P12643 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP2P12643 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP2P12643 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP2P12643 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP2P12643 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP2P12643 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP2P12643 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP2P12643 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP2P12643 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP2P12643 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMP2P12643 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP2P12643 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP2P12643 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP2P12643 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP2P12643 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP2P12643 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP2P12643 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP2P12643 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP2P12643 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP2P12643 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP2P12643 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP2P12643 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP2P12643 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP2P12643 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP2P12643 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP2P12643 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP2P12643 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP2P12643 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP2P12643 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP2P12643 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP2P12643 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP2P12643 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP2P12643 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP2P12643 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP2P12643 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP2P12643 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP2P12643 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP2P12643 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP2P12643 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP2P12643 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP2P12643 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP2P12643 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP2P12643 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP2P12643 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BMP2P12643 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP2P12643 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP2P12643 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP2P12643 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP2P12643 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP2P12643 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP2P12643 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP2P12643 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP2P12643 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP2P12643 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP2P12643 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP2P12643 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP2P12643 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP2P12643 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP2P12643 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP2P12643 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP2P12643 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP2P12643 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP2P12643 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP2P12643 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP2P12643 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP2P12643 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms