Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKBP12277 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKBP12277 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKBP12277 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKBP12277 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKBP12277 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKBP12277 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CKBP12277 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CKBP12277 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKBP12277 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKBP12277 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKBP12277 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKBP12277 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKBP12277 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKBP12277 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CKBP12277 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKBP12277 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKBP12277 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKBP12277 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CKBP12277 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKBP12277 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKBP12277 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKBP12277 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKBP12277 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKBP12277 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKBP12277 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKBP12277 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKBP12277 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKBP12277 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKBP12277 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKBP12277 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKBP12277 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKBP12277 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKBP12277 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKBP12277 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKBP12277 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKBP12277 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKBP12277 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKBP12277 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKBP12277 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CKBP12277 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKBP12277 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKBP12277 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKBP12277 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKBP12277 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKBP12277 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKBP12277 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKBP12277 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKBP12277 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKBP12277 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKBP12277 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKBP12277 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKBP12277 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKBP12277 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKBP12277 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CKBP12277 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKBP12277 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKBP12277 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKBP12277 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CKBP12277 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKBP12277 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKBP12277 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKBP12277 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKBP12277 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CKBP12277 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKBP12277 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKBP12277 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKBP12277 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKBP12277 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKBP12277 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKBP12277 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKBP12277 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKBP12277 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKBP12277 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CKBP12277 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKBP12277 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKBP12277 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKBP12277 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKBP12277 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKBP12277 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKBP12277 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKBP12277 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKBP12277 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKBP12277 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKBP12277 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKBP12277 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKBP12277 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CKBP12277 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKBP12277 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKBP12277 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKBP12277 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CKBP12277 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKBP12277 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms