Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT3P12035 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT3P12035 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT3P12035 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT3P12035 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT3P12035 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT3P12035 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT3P12035 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT3P12035 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT3P12035 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT3P12035 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT3P12035 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT3P12035 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT3P12035 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT3P12035 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT3P12035 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT3P12035 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT3P12035 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT3P12035 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT3P12035 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT3P12035 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT3P12035 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT3P12035 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT3P12035 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT3P12035 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT3P12035 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT3P12035 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT3P12035 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT3P12035 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT3P12035 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT3P12035 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT3P12035 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT3P12035 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT3P12035 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT3P12035 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT3P12035 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT3P12035 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT3P12035 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT3P12035 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT3P12035 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT3P12035 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT3P12035 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT3P12035 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT3P12035 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT3P12035 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT3P12035 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT3P12035 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT3P12035 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT3P12035 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT3P12035 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT3P12035 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT3P12035 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT3P12035 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT3P12035 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT3P12035 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT3P12035 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT3P12035 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT3P12035 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT3P12035 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT3P12035 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT3P12035 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT3P12035 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT3P12035 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT3P12035 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT3P12035 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT3P12035 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT3P12035 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT3P12035 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT3P12035 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT3P12035 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT3P12035 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT3P12035 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT3P12035 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT3P12035 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms