Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGFB3P10600 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TGFB3P10600 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TGFB3P10600 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TGFB3P10600 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TGFB3P10600 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TGFB3P10600 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TGFB3P10600 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TGFB3P10600 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TGFB3P10600 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TGFB3P10600 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TGFB3P10600 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TGFB3P10600 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TGFB3P10600 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TGFB3P10600 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TGFB3P10600 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TGFB3P10600 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TGFB3P10600 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TGFB3P10600 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TGFB3P10600 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms