Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGB3P0DN86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CGB3P0DN86 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGB3P0DN86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms