Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTAP09496 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTAP09496 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTAP09496 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTAP09496 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTAP09496 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTAP09496 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTAP09496 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTAP09496 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTAP09496 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTAP09496 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTAP09496 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTAP09496 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTAP09496 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTAP09496 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTAP09496 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTAP09496 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTAP09496 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTAP09496 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTAP09496 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTAP09496 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTAP09496 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTAP09496 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTAP09496 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTAP09496 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTAP09496 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTAP09496 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTAP09496 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTAP09496 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTAP09496 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTAP09496 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTAP09496 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTAP09496 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTAP09496 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTAP09496 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTAP09496 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTAP09496 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTAP09496 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTAP09496 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTAP09496 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTAP09496 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTAP09496 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTAP09496 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTAP09496 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTAP09496 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTAP09496 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTAP09496 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTAP09496 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTAP09496 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTAP09496 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTAP09496 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTAP09496 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTAP09496 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTAP09496 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTAP09496 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTAP09496 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTAP09496 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTAP09496 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTAP09496 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTAP09496 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTAP09496 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTAP09496 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTAP09496 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTAP09496 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTAP09496 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTAP09496 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTAP09496 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTAP09496 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTAP09496 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTAP09496 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTAP09496 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTAP09496 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTAP09496 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTAP09496 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTAP09496 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTAP09496 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTAP09496 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CLTAP09496 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTAP09496 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTAP09496 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTAP09496 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTAP09496 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTAP09496 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTAP09496 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms