Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACAA1P09110 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA1P09110 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA1P09110 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA1P09110 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms