Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRCP08575 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRCP08575 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCP08575 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
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