Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRAP08240 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRAP08240 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms