Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSBP07858 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSBP07858 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSBP07858 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSBP07858 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSBP07858 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSBP07858 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSBP07858 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSBP07858 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSBP07858 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSBP07858 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSBP07858 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSBP07858 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSBP07858 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSBP07858 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSBP07858 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSBP07858 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSBP07858 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSBP07858 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSBP07858 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSBP07858 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSBP07858 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSBP07858 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSBP07858 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSBP07858 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSBP07858 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSBP07858 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSBP07858 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSBP07858 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSBP07858 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSBP07858 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSBP07858 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSBP07858 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSBP07858 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSBP07858 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSBP07858 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSBP07858 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSBP07858 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSBP07858 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSBP07858 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSBP07858 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSBP07858 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSBP07858 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSBP07858 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSBP07858 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSBP07858 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSBP07858 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSBP07858 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSBP07858 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSBP07858 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSBP07858 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSBP07858 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSBP07858 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSBP07858 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSBP07858 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSBP07858 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSBP07858 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSBP07858 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSBP07858 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSBP07858 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSBP07858 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSBP07858 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSBP07858 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSBP07858 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSBP07858 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSBP07858 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSBP07858 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms